Durante la segunda mitad del siglo XVIII se fueron creando en la Intendencia de Arizpe, grupos de españoles o de criollos, hijos de españoles nacidos en las Colonias, que amasaron grandes fortunas y se llamaba a sí mismos, los Notables,  estaban relacionados con toda clase de intereses económicos, entre los que destacaba la minería; la población estimada en 1804 era de casi 100,000 habitantes.

En Sonora no existieron brotes de rebelión que apoyaran  el movimiento de Independencia encabezado por Miguel Hidalgo, debido principalmente a la lejanía con la capital de la Nueva España  y la ruta comercial de recuas de mulas, además que los intereses económicos de los Notables no se vieron afectados y no había motivos para participar a favor de la causa del movimiento insurgente.

De 1790 a 1820 el puerto de San Blas, Nayarit, abierto al libre comercio con barcos españoles, era el centro regional más importante del comercio de la Intendencia de Arizpe.

1782 El Comandante general de las Provincias Internas de Occidente, recibe la transcripción de un comunicado del rey de España, era una cédula real que otorgaba a Arizpe la categoría de ciudad y capital de la Intendencia de Sonora y Sinaloa; así mismo, que la Comandancia quedara instalada allí.

José María González Hermosillo, llega en 1810 con sus huestes a Tepic, con la instrucción de Miguel Hidalgo de traer la guerra de Independencia a las provincias del noroeste, caudillo que nunca llegó a Sonora, al ser derrotado por Alejo García Conde en 1811. Por decreto del Congreso del Estado de Occidente en memoria del caudillo se puso su nombre a la antigua Villa del Pitic, otorgándole a la vez la categoría de ciudad.

Es expedida la Constitución Española en 1812, que dio lugar a que en la Provincia de Sonora y en otras, se constituyeran las Diputaciones Provinciales, que daban cierta autonomía a los residentes de la Nueva España.

España abre el libre comercio total en el puerto de Guaymas en 1820, en donde los mercaderes de la Intendencia de Sonora y Sinaloa, también llamada de Arizpe, operaron de manera abierta y se podía comerciar libremente entre las colonias y la metrópoli española. Con esta medida dejó de ser El Rosario, Sinaloa el centro comercial regional más importante.

José María Elías González de Arizpe, se da de alta en el Ejército Virreinal y lucha contra los independentistas en Durango, Coahuila, Zacatecas y Jalisco, en 1821 se presentó al general Pedro Celestino Negrete, secundando el Plan de Iguala, después de la Independencia ocupó cargos públicos y fue gobernador de Sonora por breve tiempo.

Por acta constitutiva de la Federación en 1824, se establece el Estado de Occidente, con los territorios de las antiguas provincias de Sonora y Sinaloa, siendo confirmado por la Constitución Federal del mismo año, hubo inestabilidad en la fijación de poderes, culminando hasta 1831 cuando se erigen los Estados de Sonora y Sinaloa.

Fallece Rafael Morales en 1831, originario del mineral de Montepori, fue alcalde constitucional de Arizpe, con cuyo carácter  juró la Independencia en 1821 de acuerdo con las bases del Plan de Iguala, se encargó también de la jefatura política de Sonora.

Se instala en Hermosillo el primer Congreso Constituyente quien elabora y expide la primera Constitución Política del Estado de Sonora en 1831, siendo los primeros mandatarios Leonardo Escalante y Mazón como gobernador  y, Tomás Escalante y Corella como vicegobernador.

Ignacio de Bustamante que nació en Banámichi, muere en Arizpe en 1839, se hizo cargo del gobierno de las provincias de Sonora y Sinaloa a partir de 1808; en 1821 aprobó el Plan de Iguala y continuó ocupando cargos importantes, en 1832 fue electo vicegobernador cargo que desempeñó hasta 1836.

Pedro García Conde, de Arizpe, que era ingeniero es nombrado reconstructor del hoy Palacio Nacional, fue secretario de Guerra y Marina en 1844, después de los Tratados de Guadalupe Hidalgo en 1848, es nombrado presidente de la Comisión de fijar los límites con Estados Unidos.